Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPCP11686 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms