Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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UBXN4Q92575 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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UBXN4Q92575 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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