Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms