Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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