Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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