Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms