Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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