Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms