Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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