Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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