Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SDSP20132 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SDSP20132 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SDSP20132 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SDSP20132 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SDSP20132 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms