Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNMO15061 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYNMO15061 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms