Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms