Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms