Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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