Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms