Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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