Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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