Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms