Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL4A6Q14031 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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