Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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ITGA9Q13797 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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ITGA9Q13797 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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ITGA9Q13797 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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ITGA9Q13797 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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