Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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