Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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