Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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