Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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VAX2Q9UIW0 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAX2Q9UIW0 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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