Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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