Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms