Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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