Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms