Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms