Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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