Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms