Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFXAPO00287 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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