Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ERVV-2B6SEH9 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms