Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms