Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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