Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms