Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TAF1AQ15573 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms