Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms