Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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