Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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