Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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