Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NME3Q13232 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms