Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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