Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
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