Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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