Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD13P35453 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD13P35453 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD13P35453 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD13P35453 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD13P35453 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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