Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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