Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXA3O43365 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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