Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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COPS7AQ9UBW8 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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COPS7AQ9UBW8 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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COPS7AQ9UBW8 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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